Molekulyar sifəti fransız dilindən (moléculaire) gəlmişdir və "molekul" sözündən törəmədir. Əsas mənası "molekulla əlaqədar olan", "molekulu əhatə edən" və ya "molekulların xassələrini və davranışlarını əks etdirən" deməkdir. Bu məna iki əsas istiqamətdə özünü göstərir:
Birinci məna: Molekulların tərkibi, quruluşu və xassələri ilə bağlı olan. Bu mənada "molekulyar" sözü kimyəvi birləşmələrin molekulyar quruluşuna, molekulyar çəkilərinə, molekullararası qüvvələrə və s. aiddir. Məsələn, "molekulyar çəki" ifadəsi bir maddənin bir molunun kütləsini göstərir və bu, birbaşa molekulun tərkibini və atomların sayını əks etdirir. Başqa bir nümunə olaraq "molekulyar spektroskopiya" metodunun molekulların enerji səviyyələrini və quruluşlarını öyrənməkdə istifadə edildiyini göstərmək olar. Həmçinin, "molekulyar biologiya" termini DNT, RNT və zülallar kimi bioloji makromolekulların öyrənilməsinə həsr olunmuş bir elmi sahəni təsvir edir.
İkinci məna: Molekulların tədqiqi ilə bağlı olan. Bu mənada "molekulyar" sözü molekulyar fizika, molekulyar kimya, molekulyar biologiya kimi elm sahələrini və ya bu sahələrdə istifadə olunan üsulları, nəzəriyyələri və modelləri ifadə edir. Məsələn, "molekulyar nəzəriyyə" maddələrin makroskopik xassələrinin mikroskopik quruluşları ilə əlaqəsini izah edən bir nəzəriyyədir. "Molekulyar modelləşdirmə" isə kompüter proqramları ilə molekulların quruluşunu və davranışını simulyasiya etmək prosesidir. "Molekulyar genetika" isə genlərin və onların ifadəsinin öyrənilməsi ilə məşğul olan bir sahədir.
Qısacası, "molekulyar" sözü həm molekullara aid olan xüsusiyyətləri, həm də onların öyrənilməsi ilə bağlı sahələri və metodları ifadə edən geniş mənalı bir termindir. Onun istifadəsi kontekstdən asılı olaraq dəyişir, lakin hər iki halda da molekullarla əlaqəni vurğulayır.